乳品加工厂购进牧场的鲜奶，可按购进农产品处理，即按收购额计提１３％的进项税额。如果其他辅助材料的成本都是在生产乳制品过程中发生的，则乳制品加工厂当年应纳增值税２１００×１７％－１３００×１３％－４５＝１３４万元，应缴城建税及教育费附加１３４×（７％＋３％）＝１３．４（万元）。
一般纳税人农产品加工生产企业缴纳增值税，一般的农产品收购税率为13%。从2019年7月1日起，将增值税税率由四档减至17%、11%和6%三档，取消13%这一档税率。将农产品、天然气等增值税税率从13%降至11%。对农产品深加工企业购入农产品维持原扣除力度不变，避免因进项抵扣减少而增加税负。
交增值税，你收购粮食的时候可以13%抵扣，但是你出售的时候就是17%的税率了。其他就是相关的地税，城建、教育费附加等七七八八的小税种了。
主要是保护农民利益，所以是低税率。从今年2020年7月1日起，将增值税税率由四档减至17%、11%和6%三档，取消13%这一档税率。将农产品、天然气等增值税税率从13%降至11%。对农产品深加工企业购入农产品维持原扣除力度不变，避免因进项抵扣减少而增加税负。
公司收购农产品销售〈直接或加工后〉要交增值税，小规模纳税人3%，—般纳税人13%〈不在规定农产品范围内，有可能17%），选择—般纳税人纳税为好，收购农户的农产品依买价抵扣13%的进项税，造成公司税负很低或为零.2，农产品加工企业免征戓减半征征企业所得税（不在规定农产品范围内要交企业所得税）。
深加工的设备采购进项税率是17%；深加工采购的辅助材料，包装物等大部份进项税率也是17%；在价税分离的原则下，只要核算好销售定价，对企业来讲也能得到合理的毛利率。
一般来说，农产品初加工可以按照增值税一般纳税人的方式缴纳增值税，也可以按照小规模纳税人的方式缴纳增值税。具体缴纳方式需要根据企业的具体情况和税务政策来确定。对于增值税一般纳税人来说，农产品初加工企业需要计算销项税额和进项税额，然后按照差额缴纳增值税。
一般纳税人农产品加工生产企业缴纳增值税，一般的农产品收购税率为13%。销项税额-进项税额=应交增值税额，销项税额是指销售收入的税额，进项税额是指收购农产品的税额，一般的农产品收购税率为13%。增值税是以商品（含应税劳务）在流转过程中产生的增值额作为计税依据而征收的一种流转税。
一般纳税人农产品加工生产企业适用9%税率。纳税人销售或者进口下列货物，税率为9%：粮食、食用植物油、自来水、暖气、冷气、热水、煤气、石油液化气、天然气、沼气、居民用煤炭制品、图书、报纸、杂志、饲料、化肥、农药、农机、农膜、农业产品、以及国务院规定的其他货物。
计算公式为：进项税额=买价*扣除率买价，是指纳税人购进农产品在农产品收购发票或者销售发票上注明的价款和按照规定缴纳的烟叶税。一般纳税人购进农产品抵扣进项税额如下：从一般纳税人购进农产品，按照取得的增值税专用发票上注明的增值税额，从销项税额中抵扣。
以增值税专用发票上注明的金额和百分之九扣除率计算进项税额；取得农产品销售发票或收购发票的，以农产品销售发票或收购发票上注明的农产品买价和百分之九扣除率计算进项税额；纳税人购进用于生产销售或委托受托加工百分之十三率货物的农产品，以农产品买价和百分之十扣除率计算进项税额。
三）购进农产品，除取得增值税专用发票或者海关进口增值税专用缴款书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和13%的扣除率计算的进项税额。
销项是：价税合计/（1+适用税率）*适用税率；进项是凭票认证上的税额或是计算抵扣。计算抵扣的有：农产品可能抵扣9%，深加工加扣1%，另外通行费电子普通发票；旅客运输的普通发票、火车票、飞机票。
从一般纳税人那里购买农产品，获得9%税率的增值税专用发票，可以凭票扣除，即直接认证扣除；你也可以选择计算扣除额。
1、如果是从农户手里直接收购农产品，由于农户开不了发票，所以，需要收购企业自行开具农产品收购发票或者农户去税务局代开农产品免税发票。一般纳税人企业在收到普通发票后，根据票面金额乘以9%计算进项税金并据此进项抵扣，以总金额减去税金后的金额入库。
2、一般纳税人把小麦加工成面粉，仍然属于农产品，适用增值税税率13%。财政部、国家税务总局关于印发《农业产品征税范围注释》的通知（财税字[1995]52号）：农业产品是指种植业、养殖业、林业、牧业、水产业生产的各种植物、动物的初级产品。
3、纳税人购进农产品，原适用10%扣除率的，扣除率调整为9%。纳税人购进用于生产或者委托加工13%税率货物的农产品，按照10%的扣除率计算进项税额。
4、除进货为13%的应缴的增值税为13%外，其他的都是应缴的增值税为17%。
农产品加计扣除1%的计算方法如下：需要确定农产品的销售收入，即销售农产品所得的金额。符合条件的农产品包括：小麦、玉米、大豆、棉花、油菜籽等主要粮食和油料作物，以及鸡蛋、猪肉、牛肉、羊肉等畜禽产品。将销售收入乘以1%（即0.01），得出加计扣除的金额。
是按9%抵扣，生产的话可以加扣1%。农产品加计扣除1%计算是在生产环节，会计分录：可以抵扣的进项税额=原材料成本*1%。 购进农产品进项税的扣除规定是： 一般纳税人开具的增值税专用发票，购进企业可以按规定进行抵扣，即可以按照票面注明的税额抵扣； 海关进口增值税专用缴款书。
一般有加计扣除和加计抵减两种。符合条件的，纳税人还可以在加计扣除的基础上适用加计抵减政策。 01 取得增值税专用发票 纳税人购进农产品取得增值税专用发票的，以增值税专用发票上注明的增值税额为进项税额。
%：一般纳税人销售交通运输、邮政、基础电信、建筑、不动产租赁服务、销售不动产、转让土地使用权、销售或进口特定货物（民生类货品）。 6%：除以上提及的以外业务，主要包括销售增值电信、金融服务、现代服务、生活服务等。
加计扣除符合条件的农产品加计扣除政策规定：依据《财政部 税务总局 海关总署关于深化增值税改革有关政策的公告》（财政部 税务总局 海关总署公告2019年第39号）第二条：“纳税人购进农产品，原适用10%扣除率的，扣除率调整为9%。
农产品收购发票或者销售发票，且必须是农业生产者销售自产农产品适用免税政策开具的普通发票；取得一般纳税人开具的增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书；从按照3%征收率缴纳增值税的小规模纳税人处取得的增值税专用发票。